また仕様変更でもあったのでしょうか？
とりあえずhotmail.comのアカウントは[ツール]→[拡張機能]→[WebMail - Hotmail]を選んで[設定]を押し、Modeを「WebDev」に変更したら受信できました。
ただ設定を変えると一度受信したことがあるメールも受信してしまうようです。
重複メールの対策は前に書いた記事を参考に(もしかすると参考にならないかも)
hotmail.co.jpのアカウントは、いろいろいじってみましたが
「パスワードの送信は成功しませんでした。メールサーバ localhost が応答しました:negative vibes from ***@hotmail.co.jp」
というメッセージが出て受信できません。
とりあえず拡張機能のバージョンアップを待つしか無いのかな…
(追記)
Thunderbird v2にアップデートし、「WebMail」と「WebMail - Hotmail」のアドオンを最新版にしたところHotmailを受信できるようになりました。
Hotmail(Windows Live)は仕様変更が定期的にあり、いままでメール受信ができていても、しばらくたつと出来なくなるということが多いです。
とりあえず、受信できなくなった場合は、「WebMail」と「WebMail - Hotmail」の更新を待つしかないみたいです。
